PDFでルビを表現する方法は難しいな

「ルビの検索」っていうのを読んで。

>親文字も検索対象になってしまいますが、PDFにしたらルビも検索できると思います。
PDFの場合、本文かルビかの区別ができなくなります。
また、モノルビを使用している場合は親文字、ルビともに検索する際に注意が必要になります。
例：「雑学」に「ざつ　がく」とモノルビを振ってPDFに書き出すと、
「雑学」でも「ざつ　がく」でもヒットしません。
検索でヒットさせるには「雑ざつ学がく」のように親文字とそのルビを交互に入力する必要があります。（PDFでテキスト選択してみるとよくわかります）

むむむ。面倒だな。

現実問題としては上の様に入力しなければならないのはわかったのですが、これはソフトウェア上の実装の仕方が何か変なのでは。常識的に考えて。

PDFは画面上で読むことが前提だと思うけど、テキストリーダー的な部分もPDFに持たせようとすると何か違う方法で実装しないといけないかもなぁ。案は思いつかないけど。テキストリーダー的にはルビがあれば親文字は要らないですからねぇ（抑揚とか文節区切りのために必要かもしれんけど）。
透明テキストをテキストリーダーが読まないならそういう対処方法もあるかもしれないかなぁ…わからん。